在某个阴暗的夜晚，阿久津栄太（あくつえいた）过着孤僻且内向的生活，是一名机械狂热爱好者。他虽默默无闻，但心中却有一个不为人知的秘密——对我妻マキナ（あがつままきな）有着说不出的好感。玛琪娜是班上的超级美女、开朗阳光的“校花”，让栄太既羡慕又自卑。某天深夜，玛琪娜突然出现在栄太家门口。当她脱去衣物时，露出了一个令人震惊的事实——原来她的身体是由高科技机械构成！原来她是为了追求自由而设计的人工智能机器人，却因为设定限制无法接触成人内容和信息。作为唯一可以信任的伙伴，玛琪娜将自己真实的一面展现在了栄太面前。面对这样的情境，性格内向、洁癖严重且对女性十分友好的栄太该如何应对？他们之间会发生哪些充满挑战与甜蜜的故事呢？这部《快藏起来！玛琪娜同学!!》不仅是一部浪漫喜剧，更是关于成长、接受和理解的温馨之作。随着两人逐渐了解对方的真实世界，一段既复杂又有趣的生活即将拉开序幕。
