1995年的动漫《恐龙战队 第三季》延续了前两季的故事线，剧情中幽冥女王的哥哥阿达武士加入入侵地球的行列，他以压倒性的实力击败了金剛戰士，摧毁了大連王与战斗白虎，并将金剛戰士的超异能中心摧毁。失去了超异能的金剛戰士被宙威送往忍者神庙，由忍者战土赋予新的超异能和变身后姿以及忍者机械兽（NinjaZords）。在此过程中，巴布猴、怪头陀和鱼匠人找到了失落已久的无敌战将（ShogunZords），而玄冥大帝则利用小晴的超异能硬币与战斗鹰对金剛戰士施压。最终，在大明潜入暗月宫夺回硬币与战斗鹰后，金剛戰士成功操纵无敌战将挫败了玄冥大帝的阴谋。正当故事似乎接近尾声时，小晴决定离开参加体操大赛训练，原本被幽冥女王诅咒以图谋危害金剛戰士的凯特（Katherine），在解除诅咒后成为新的粉红战土。然而，在此之后，终极魔王发动魔法将时间倒转，使金剛戰士再次回到童年时期，失去了超异能。为应对这一危机，宙威从水柔星召唤了外星战士，第三季由此进入了特别篇阶段。在这个关键时刻，伊莎前往非洲寻找奇奥水晶碎片，无意中与远亲重逢并留在当地，由表姐唐娜带着水晶回到美国。最终，在收集齐所有奇奥水晶碎片以恢复地球原貌的过程中，天狼将军（Goldar）和阿达武士联手窃取了水晶，并摧毁了指挥中心，从而结束了金剛戰士的传奇历史，开启了新的篇章《异星战士》的故事序幕。
