《灰色的乐园》的故事发生在一所名为三嶋崎的海边小镇上的私立美滨学园。雄二（樱井孝宏配音），一位新转学生，带着对未知的好奇与期待来到这里，却不曾想到自己将置身于一个仅有五名女性学生的小小世界之中。在这样一个看似宁静却充满隐秘情感纠葛的空间里，雄二的出现为她们带来了新的生机。这五个性格各异的女孩构成了学园独特的风景线：外表冷艳却内心复杂的大小姐榊由美子（田中凉子配音），她的过去充满了不可言说的秘密；天音（田口宏子配音）是个活泼开朗、略带男性特质的女生，但背后隐藏着一段不为人知的心路历程；满（水桥香织配音）坚韧而倔强，她那屡次遭遇不幸的背景让人既心疼又无奈；莳菜（民安智惠配音），虽然外表天真无邪，但实际上却背负着深重的秘密；幸（清水爱配音），虽性格单纯但有时会显得有些笨拙，然而正是这份天然的呆萌为她的朋友们带来了许多欢乐。雄二的到来，能否成为她们生命中一抹温暖的阳光，照亮她们心中那些久未触及的角落？随着故事的发展，五位女孩将通过各自独特的方式与雄二相互了解、相互成长，在这片灰色的乐园里寻找属于自己的光明与希望。
