在公元2015年的时代背景中，人类社会依然保留着神秘的魔术传统。为了预测和干预未来的灾难，人理继续保障机关“Chaldea”开发了一种名为“Sheba”的近未来观测镜。然而，观测镜却突然揭示出一个惊人预言：2016年将是人类历史的终结。面对这一危机，Chaldea决定启用禁忌仪式“GrandOrder”，将术师灵子化并送回过去，试图阻止灾难的发生。在这样背景下，一场扭曲的冬木圣杯战争爆发了。Saber（阿尔托利亚·潘德拉贡）因种种原因黑化，并杀死了除Caster以外的所有从者，甚至毁灭了整个冬木市。与此同时，大空洞中，等待着Caster的到来。而这一次，Caster的身份是库·丘林。他坚信如果职阶为Lancer，便能轻易击败Saber。在这场疯狂的圣杯战争中，主角玛修、奥尔嘉以及雷夫等人的介入，最终成功阻止了这场灾难，但Saber与Caster双双消失，意味没有人获得圣杯。然而，剧情并未就此结束。在关卡最后消灭了奥尔嘉玛丽灵魂的同时，雷夫也揭露了一个更大的秘密——究竟GrandOrder背后隐藏着什么？这一切都指向一个更加深远的谜团，等待着未来的探险者去揭开……
