《捉妖特工队》的故事发生在2018年的一个不平凡的夜晚。张凡在一次意外中遭遇到不明生物的攻击，幸得清洁工人阿乐和神秘女子安娜的帮助才得以逃脱。两人自称是隶属于“有关部门”的特工，专门处理外星人相关事务，并告诉张凡他曾经是组织中的王牌——“特工Z”。正当张凡试图恢复记忆并寻找失落的“立方体”时，他逐渐发现，阿乐与安娜的真实身份和动机远比想象中复杂。他们不仅对彼此的目的讳莫如深，而且似乎都怀有各自不可告人的计划。张凡在解谜的过程中揭开了许多隐藏的真相：阿乐其实是伪装成人类形态的外星生物，而安娜则是一位极端派别中的特工，意图彻底清除所有威胁地球的外来生命。两人的矛盾因“立方体”的出现而激化，双方都试图利用张凡达成各自的所谓正义目的。在一番激烈的交锋后，张凡逐渐站出来，用自己的智慧和勇气化解了这场危机，并逐渐揭开了背后更大的阴谋。他不仅要面对外星生物的威胁，还要在人性与正义之间找到自己的立场，最终带领大家共同对抗更强大的敌人，保护地球的安全。
