在青梅竹马的邀请下，工藤新一与毛利小五郎一同前往京都，观看正在当地拍摄的时代剧。然而，在飞行过程中，两位摄影师神秘地出现在洗手间内，这一意外事件立刻引起了乘务组的高度警惕。作为职业侦探，新一在万米高空迅速展开推理，试图解开这个悬而未决的谜团。抵达京都后，工藤新一发现这里正上演着另一场凶杀案——著名的男演员樱庭突然收到了匿名恐吓信，并很快因谋杀预告遭遇不幸。与此同时，京都摄影所内又接连发生命案，女演员成了下一个受害者。在这一系列事件的背后，似乎隐藏着一个精心策划的阴谋。新一与毛利小五郎共同行动，在当地警察和著名推理爱好者服部平次的帮助下，逐步揭开谜底。在这个充满古典气息的城市中，工藤新一不仅要运用自己的智慧破解案件，还要面对各种挑战。最终，一系列紧张刺激的推理对决将如何收场？京都的新一与小兰之行又将会留下怎样的回忆？这一切都将在电影《工藤新一 京都新撰组杀人事件》中一一揭晓。
